Les critiques de la nouvelle saison de Malcolm sont mitigées, voire très négatives pour la plupart. Beaucoup de fans de la série originale expriment leur déception et leur frustration face à la perte de l'esprit et de l'humour qui faisaient la force de la série. Les personnages, qui étaient autrefois si attachants et drôles, sont maintenant considérés comme édulcorés et rangés, avec une tendance à la moralisation et à la prédication. Le rythme de la série est également critiqué, avec des épisodes qui semblent trop courts et qui ne permettent pas de développer convenablement les histoires et les personnages. Certains fans regrettent également l'absence de personnages clés, comme Dewey, et la mauvaise intégration de nouveaux personnages, qui semblent avoir été ajoutés pour répondre à des critères de diversité et d'inclusivité. Les seuls points positifs mentionnés sont la présence de Bryan Cranston, qui reste excellent dans son rôle de Hal, et la nostalgie qui accompagne le retour de la série, mais cela ne suffit pas à compenser les nombreux défauts de la nouvelle saison. Globalement, les critiques s'accordent à dire que cette nouvelle saison de Malcolm est une déception et qu'elle ne parvient pas à recapturer l'esprit de la série originale.